2001年10月8日，日本首相小泉纯一郎对华进行工作访问，参观卢沟桥抗战纪念馆，对日本侵华历史表示反省和道歉。

2001年10月21日，江泽民主席会见出席上海APEC会议的日本首相小泉纯一郎。

2001年11月5日，中日韩三国领导人在文莱10+3会议期间举行会晤，朱钅容 基总理和日本首相小泉纯一郎出席。

2001年12月21日，中日双方就解决大葱、香菇、蔺草席三种农产品贸易争端达成共识，日方决定不启动正式保障措施，中方撤消特别关税报复措施。

2001年12月22日，日本海上保安厅巡视船追逐一艘不明国籍船只进入我专属经济区水域，双方发生交火，不明国籍船只沉没。中方对日本在东海海域使用武力表示不满。

2002年4月2日至9日，李鹏委员长对日本进行正式友好访问，并与日本首相小泉纯一郎共同出席纪念中日邦交正常化30周年“中国文化年”、“日本文化年”开幕式。

2002年4月12日，朱镕基总理会见出席博鳌论坛首届年会的日本首相小泉纯一郎。

2002年4月21日，日本首相小泉纯一郎再次参拜靖国神社。中方提出严正交涉，并推迟日本防卫厅长官中谷元访华及我海军舰艇编队访日。

2002年4月25日至28日，中共中央政治局候补委员、书记处书记曾庆红访问日本大分县。