此次灾难对日本造成的直接影响目前难以量化统计，但损失巨大。这次遭地震与海啸袭击的日本东北部沿海地区比东京地区要落后许多，“如果类似的灾难发生在东京湾，后果将不堪设想。”专家普遍认为日本国内生产总值可能因地震而下降1％。日本汽车制造商的国内工厂几乎全部停产。野村研究所的经济学家曾预测日本经济将在今年第二季度走出低迷状态，而如今在第三或第四季度之前，日本经济都不会摆脱低迷。鉴于公路和发电设施等基础设施遭受重大破坏，这次灾难对日本经济造成的短期影响可能大于神户地震的影响。

随着救灾工作的推进，国民对菅直人首相也开始流露不满。如由于供电紧张，东京电力公司要在所辖一都8县实施部分断电，菅直人只表示“知道了”，把责任推到了民营的电力公司。东京的地铁要部分关闭，日本政府没有做好宣传工作，也受到国民的诟病。菅直人在发布福岛第一核电站爆炸消息时说：“让人忧虑的状况还在继续，”但随后说：“一会儿让枝野幸男详细报告给大家。”应该首相报告的事情都推给了枝野幸男，在向社民党党首福岛瑞穗，解释政府迟迟没有公布福岛第一核电站核辐射超标问题时，菅直人说“东京电力公司事发很久才提交报告。”把责任推给了东京电力公司。而且菅直人不接受记者提问，只是向国民传递信息，也让国民感到不解。灾后重建耗资巨大，而且日本政府的债务已经达到警戒水平相当于其经济产量的225%，是全球负债率最高的国家之一。日本巨大的债务负担让人不免质疑该国是否有能力负担巨大的重建工程。这些都是菅直人面临的头疼问题，解决不好菅直人内阁随时都可能下台。（中国社会科学院日本所何晓松）